| 標題 | 版本 | 發布日期 | 
| 2021-04-19更新 | 2021-05-03 | |
| Section 1 動物科學應用之申請、使用與監督 Application and Monitor of Animal Use Protocols | ||
| SOP 100-動物實驗計畫書申請與審查 Application and Review of Animal Use Protocols | 2022-02-25更新 | 2022-02-25 | 
| SOP 101-動物實驗計畫書變更 Amendment of Animal Use Protocol | 尚在更新中 | - | 
| SOP 102-動物福祉疑慮通報程序 | 2023-05-29更新 | 2023-07-19 | 
| SOP 103-動物實驗計畫審查通過後監督計劃及內部查核作業程序 Post Approval Monitoring (PAM) Program and Procedure for Internal Auditing | 2023-05-29更新 | 2023-07-19 | 
| Section 2 動物的飼養管理 Animal Husbandry | ||
| SOP 200-齧齒類動物之飼養管理 Rodent Husbandry | 2023-06-28更新 | 2023-07-19 | 
| SOP 201-兔子之飼養管理 Rabbit Husbandry | 尚在更新中 | - | 
| SOP 202-大動物之飼養管理 Large Animal Husbandry | 2023-06-28更新 | 2023-07-19 | 
| SOP 203-大小鼠飼養於獨立換氣籠 IVC System for Housing Rats and Mice | 尚在更新中 | - | 
| SOP 204-飼料之進入與管理 Entry and Management of Feed | 尚在更新中 | - | 
| SOP 205-墊料之進入與管理 Entry and Management of Bedding | 尚在更新中 | - | 
| SOP 206-大鼠及小鼠繁殖管理 Management of Rat and Mouse Breeding | 第1.1版 | 2020-05-01 | 
| Section 3 使用者使用實驗動物中心之程序 | ||
| SOP 300-門禁申請 Appling the Access to Animal Facility | 尚在更新中 | 
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| SOP 301-人員進出9F設施程序 Personnel Enter and Exit 9F Facility | 尚在更新中 | 
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| SOP 302-人員進出8F設施程序 Personnel Enter and Exit 8F Facility | 尚在更新中 | 
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| SOP 303-動物入室申請程序 Appling Animals to Enter the Animal Facility | 尚在更新中 | 
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| SOP 304-動物進入飼育室程序 Animals Enter Housing Room | 尚在更新中 | 
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| SOP 305-手術室使用規定 Rules for Using Operating Rooms | 尚在更新中 | 
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| SOP 306-動物之標識 Tag the Animals | 尚在更新中 | 
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| SOP 307-動物代養費管理與催繳 | 尚在更新中 | 
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| Section 4 實驗動物之預防醫學 Preventive Medicine for Laboratory Animals | ||
| SOP 400-實驗動物之來源 Sources of Laboratory Animals | 尚在更新中 | 
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| SOP 401-實驗動物的接收 Receiving Animals | 尚在更新中 | 
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| SOP 402-實驗動物之運輸 Transportation of Laboratory Animals | 第3.0版 | 2020-08-06 | 
| SOP 403-齧齒動物之檢疫:大小鼠 Rodent Quarantine Program: Rat and Mouse | 2023-06-07更新 | 2023-07-20 | 
| SOP 404-豬的檢疫 Swine Quarantine Program | 尚在更新中 | 
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| SOP 405-兔的檢疫 Rabbit Quarantine Program | 尚在更新中 | 
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| SOP 406-囓齒動物之健康監測 Rodent Health Monitoring Program | 2023-06-28 | 2023-07-20 | 
| SOP 407-衛兵鼠之使用-髒墊料法 Use of Sentinel- Dirty Bedding Method | 第三版 | 2020-06-19 | 
| SOP 408-空氣落菌數量監測 Air Environmental Microbiological Monitoring | 2023-06-06更新 | 2023-07-20 | 
| SOP 409-RO水與自來水監測程序 Monitoring Water Quality | 2023-06-28更新 | 2023-07-20 | 
| SOP 410-生物快速判讀指示劑自動判讀培養器檢測作業流程 Reading of Bioindicator | 尚在更新中 | 
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| SOP 411-滅菌鍋滅菌效力監測程序 Monitoring the Effectiveness of Autoclaves | 2023-06-28更新 | 2023-07-20 | 
| SOP 412-對罹病與死亡動物之處置 Handling the Sick and Dead Animals | 尚在更新中 | 
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| SOP 413-蟲害防治 Pest Control | 尚在更新中 | 
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| SOP 414-微生物監測 Monitoring Microbes Using RODAC Plates | 2023-06-28更新 | 2023-07-20 | 
| SOP 415-動物屍體之處理 Carcass Disposal | 尚在更新中 | 
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| SOP 416-繁殖鼠鼠籠更換程序 Cage Changing for Breeding Mice with Pups | 第一版 | 2020-03-27 | 
| Section 5 實驗動物醫學技術 | ||
| SOP 500-醫療紀錄 Medical Record | 尚在更新中 | 
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| SOP 501-安樂死之時機與方法 Criteria and Methods for Euthanasia | 尚在更新中 | 
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| SOP 502-實驗動物之麻醉 Laboratory Animals Anesthesia | 尚在更新中 | 
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| SOP 503-實驗動物手術程序與術後照顧 Surgery Procedure and Post-Surgery Care | 尚在更新中 | 
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| SOP 504-動物保定 Laboratory Animal Restraint | 尚在更新中 | 
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| SOP 505-動物採血技術 Blood Collection for Laboratory Animals | 尚在更新中 | 
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| SOP 506-動物注射及口服藥物技術 Compound Administration for Laboratory Animals | 尚在更新中 | 
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| SOP 507-ABSL-2感染動物室人員進出程序 Entering the ABSL-2 Animal Housing Room | 尚在更新中 | 
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| SOP 508-ABSL-2感染動物實驗室使用規則 Rules for Using ABSL-2 Animal Housing Room | 尚在更新中 | 
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| SOP 509-ABSL-2生物安全櫃操作程序 Using BSC in ABSL-2 Animal Housing Room | 尚在更新中 | 
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| Section 6 職業健康與安全計畫 Occupational Health and Safety Program | ||
| SOP 600-個人衛生及健康注意事項 Personal Health and Hygiene | 尚在更新中 | 
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| SOP 601-健康檢查 Medical Examination | 尚在更新中 | 
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| SOP 602-緊急醫療程序 Emergency Medical Management for Personnel | 2023-05-25更新 | 2023-07-20 | 
| SOP 603-實驗動物過敏 Laboratory Animal Allergy | 尚在更新中 | 
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| SOP 604-個人衛生與安全防護 Protection of Personal Health and Hygiene | 尚在更新中 | 
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| SOP 605-廢棄物處理流程 Handling the Waste | 尚在更新中 | 
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| Section 7 工作人員注意事項 | ||
| SOP 701-新進人員注意事項 Precautions for Newcomers | 本中心內部SOP,不公開 | |
| SOP 702-假日值班標準操作程序 Working Procedure on Weekend and Holiday | 本中心內部SOP,不公開 | |
| Section 8 危機處理與緊急通報流程 Crisis Management and Reporting | ||
| SOP 801-空調系統故障處理程序 Handling the Failure of Heating, Ventilation, and Air-Conditioning | 本中心內部SOP,不公開 | |
| SOP 802-動物中心危機處理與功能維持 Emergency Management Plans | 本中心內部SOP,不公開 | |
| Section 9 大型機械設備與儀器之操作與維護 | ||
| SOP 900-總則 | 本中心內部SOP,不公開 | |
| SOP 901-滅菌鍋操作程序 Operation of Autoclave | 本中心內部SOP,不公開 | |
| SOP 902-飼養器材滅菌程序 Autoclave Sterilization | 本中心內部SOP,不公開 | |
| SOP 903-鍋爐簡易操作程序 | 本中心內部SOP,不公開 | |

